Os trofozoítos medem de 10 a 60µm de tamanho, com média de 15 a 30µm. Apresentam um núcleo com cariossoma pequeno e central e cromatina periférica distribuída uniformemente na membrana nuclear. O citoplasma é diferenciado em ectoplasma hialino e endoplasma finamente granuloso. Importante lembrar que são diagnosticadas nas fezes humanas outras espécies de amebas, tais como Entamoeba dispar, Entamoeba coli, Entamoeba hartmanni, Endolimax nana e Iodamoeba bütschlii.

A E. histolytica e a E. dispar são morfologicamente idênticas e, portanto, recomenda-se que a expressão do resultado do exame parasitológico de fezes seja trofozoítos de Entamoeba histolytica/E. dispar. Quando da presença de hemácias no citoplasma do trofozoíto, esta é uma característica relevante de diagnóstico da E. histolytica.

Para o diagnóstico diferencial, veja amebas comensais do intestino do homem:

• Cistos de E. coli
• Trofozoítos de E. coli
• Cistos de E. nana
• Trofozoítos de E. nana
• Cistos de Iodamoeba bütschlii