Os cistos medem de 5 a 12µm de tamanho. Quando corados pela solução de lugol são ovais ou esféricos, com citoplasma apresentando coloração verde-clara. Contém quatro núcleos pouco visíveis, em virtude de seu pequeno tamanho. Nas preparações coradas (hematoxilina férrica, tricrômico), o cariossoma é grande e irregular, membrana nuclear fina e ausência de cromatina periférica na membrana nuclear. No citoplasma às vezes poidem ser vistos corpos cromatóides pequenos e ovóides.

Outras amebas comensais:

• Cistos de E. coli
• Trofozoítos de E. coli
• Trofozoítos de E. nana
• Cistos de Iodamoeba bütschlii