Fotografias em Microscópio Oocistos de Cryptosporidium spp (4-6µm)
Os oocistos são esféricos ou ovóides, pequenos,medem de 4 a 6µm, a parede é espessa e o citoplasma é finamente granulado com uma zona central clara. Alguns oocistos apresentam grânulos escuros no seu interior. Nas colorações derivadas do Ziehl-Neelsen apresentam-se corados do rosa ao vermelho, ao púrpuro intenso, sobre um fundo azul ou verde. Alguns dos quatro esporozoítos dispostos em forma de "C" podem ser vistos nos oocistos.
Nos esfregaços corados pelo método da safranina os oocistos aparecem corados em brilhante vermelho-alaranjado.